Jean chegou no São Paulo no começo de 2018, a expectativa era que o goleiro assumisse a vaga de titular da equipe, mas não foi o que aconteceu…
O São Paulo adquiriu Jean por R$ 6 milhões pelos 75% do atleta, e ficou acertado que fecharia os outros 25% por R$ 4 milhões, mas desde que ele fosse titular em 60% das partidas entre janeiro de 2018 e junho de 2019, pois passou longe…
No período, o São Paulo disputou 97 jogos, e o Jean foi titular em 20, sendo assim 20%, para ter alcançado o número, o goleiro teria que ter feito 59 jogos.
Jean, 23 anos, foi reserva de Sidão durante quase 2018 inteiro, chegou a ter uma sequência no início do ano, quando o titular teve uma lesão, mas não agradou tanto e voltou para o banco. Sidão não vivia boa fase, mas seguia na titularidade, Jean atuava na Copa Sul-Americana, pois o time logo foi eliminado, pois o goleiro ainda foi titular nas nove últimas rodadas do Brasileirão 2018.
Em 2019 viu o clube contratar Tiago Volpi, perdeu mais espaço, foi titular somente contra o São Bento no Paulistão, ainda foi afastado em um período devido a ato de indisciplina com o então técnico Vagner Mancini, mas pediu desculpas e retornou.